انتشار کتاب‌های معتبر دانشگاهی اگرچه از دیرباز مورد توجه انتشارات فاطمی بوده است، اما هم‌اکنون با رویکرد و برنامه‌ای جدید در این انتشارات دنبال می‌شود. این برنامه در ابتدا با تالیف و ترجمه‌ی کتاب‌های پایه برای دروس عمومی رشته‌های مختلف در سطح کارشناسی به ویژه کتاب‌های عمومی ریاضی، کامپیوتر، فیزیک، شیمی، زیست‌شناسی، فنی و مهندسی، ادبیات فارسی و هنر آغاز شده است.